W 1999r. w wyniku reformy systemu oświaty powstaje gimnazjum, które 3 listopada 2001r. otrzymuje imię Jana Pawła II od tego czasu szkoła funkcjonuje jako dwie odrębne jednostki, które w 2002r. zostają połączone w Zespół Szkół.

Szkoła jest organizatorem Wojewódzkiego Konkursu Literacko – Plastycznego „Jan Paweł II – Patron Najgodniejszy” oraz Gminnego Konkursu Matematycznego dla klas I – III szkoły podstawowej.

Uczniowie szkoły podstawowej i gimnazjum biorą udział w licznych konkursach gawędziarskich, recytatorskich, plastycznych, organizowanych przez Gminny Ośrodek Kultury w Poroninie w zawodach sportowych na szczeblu gminnym, powiatowym, wojewódzkim i międzynarodowym organizowanym przez MCK „Jutrzenka” w Zakopanem.

W konkursach, zawodach uczniowie naszej szkoły zdobywają liczne nagrody i wyróżnienia.

Uczniowie szkoły włączają się do wielu prac w charakterze wolontariuszy
m. in.

- Wielka Orkiestra Świątecznej Pomocy,
- Akcję Honorowego Oddawania Krwi,
- udział w Akcji Sprzątania Świata.

Szkoła współpracuje z:
- Parafią w organizowaniu ważnych uroczystości religijno – patriotycznych,
- Rejonowym Zarządem Ligi Ochrony Przyrody,
- Rejonowym Zarządem PCK w Zakopanem,
- Związkiem Podhalan w Zębie oraz Związek Podhalan w Ameryce Północnej,
- Międzyszkolnym Ośrodkiem Sportu w Rabce,
- Ochotniczą Strażą Pożarną w Zębie
- Stowarzyszeniem Wspólnota Polska
- Tatrzańskim Parkiem Narodowym.

Szkoła organizuje spotkania ze sławnymi ludźmi m. in. Jerzy Bielecki, więzień obozu koncentracyjnego w Oświęcimiu oraz coroczne spotkanie z kompozytorem prof. H. Mikołajem Góreckim mieszkańcem Zębu

sala gimnastyczna